大数据时代的转录组研究策略.pdf

发布时间：2022-06-09 发布人：admin 分类：说明书资料大小：7.65M 资料格式：pdf 举报版权申诉

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大数据时代的转录组研究策略

大数据时代的转录组研究策略一、转录组概述二、转录组研究方案 1、mRNA研究方案 2、microRNA研究方案 3、piRNA研究方案 4、lncRNA研究方案三、高通量技术在转录组研究中的应用 1、高通量测序技术的应用 2、表观转录组学研究 3、exosome研究应用 4、高通量筛选技术应用附：miRNA动物实验方案 5、lncRNA研究应用四、走进锐博生物 2

前言：充满机遇不挑战的大数据时代 3

一、转录组概述 LncRNA 4

复杂的转录组“地图” 5

RNA重大历叱事件 • 1977年Roberts and Sharp发现RNA splicing,荣获1993年诺贝尔医学奖 • 1981年中科院等完成了酵母tRNA-Ala的人工全合成。这是世界上首次人工合成的一个具有生物活性的tRNA • 1981年Cech等发现四膜虫rRNA的自我剪接，从而发现核酶（ribozyme）；与 Altman 荣获1989年诺贝尔化学奖 • 1993年Ambros发现第一个miRNA(lin-4 ）（未来的诺贝尔奖？） • 1995年 Su Guo针对par1基因的正义序列RNA更有抑制效率 • 1998年Fire和Mello发现RNAi,获得2006年度诺贝尔医学奖 • 1999年Moore和Steitz等发现核糖体是核酶 • 2000年Reinhart等发现第二个miRNA(let-7 ） • 2001年Tuschl等发现siRNA(small interfering RNA) • 2006年Tuschl和Hannon等发现piRNA • 2012年ENCODE计划公布阶段性结果，揭示基因组中80%的非编码基因是有功能的； Mello发现线虫体内的piRNA通过表观遗传调控抑制外源入侵转座子的表达 6

RNA世界假说 1981年诺贝尔化学奖获得者吉尔伯特：生命起源的某个时期，生命体仅由一种高分子化合物RNA组成。遗传信息的传递建立于RNA的复制，其复制机理与当今DNA复制机理相似。此时，作为生物催化剂的由基因编码的蛋白质还不存在。RNA是惟一的既能携带遗传信息又可以是功能分子的生物高分子化合物。原始的具有自我复制能力的RNA，在以后的亿万年进化过程中，逐渐将其携带遗传信息的功能传给了DNA，将其功能分子的功能，传给了蛋白质。 7

Thomas R.Cech不核酸酶 Thomas R.Cech T.R.Cech（1947-）,因发现RNA的生物催化作用而与奥尔特曼共同获得1989年诺贝尔化学奖. 他独立地发现核糖核酸(RNA)不仅像过去所设想的那样仅被动地传递遗传信息,还起酶的作用, 能催化细胞内的为生命所必需的化学反应.在他们的发现之前,人们认为只有蛋白质才能起酶的作用.他最先证明RNA分子能催化化学反应,并于 1982年公布其研究结果.1983年证实RNA的这种酶活动. 1982: Self-splicing in Tetrahymena pre-rRNA (group I intron) Kruger et al, and Cech, Cell 31, 147-157 (1982) 8 8

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