R命令速查手册.pdf

发布时间：2022-05-30 发布人：admin 分类：说明书资料大小：0.33M 资料格式：pdf 举报版权申诉

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R 语言命令速查手册 R 的安装载入与帮助查询 .......................................................................................... - 2 - 一、二、数据对象的类型与建立 .............................................................................................. - 2 - 三、数据的浏览与编辑 ...................................................................................................... - 3 - 四、数据的运算 .................................................................................................................. - 3 - 五、数据的存储与读取 ...................................................................................................... - 3 - 六、程序命令 ...................................................................................................................... - 4 - 七、绘图函数 ...................................................................................................................... - 4 - 八、绘图参数 ...................................................................................................................... - 5 - 九、常用概率分布命令 ...................................................................................................... - 6 - 十、基本统计分析函数 ...................................................................................................... - 7 - - 1 -

R 语言命令速查手册一、 R 的安装载入与帮助查询 1 2 3 4 5 6 7 8 9 命令 install.packages(“程序包 ”) library(“程序包”) help.start( ) help( 函数) 或 ?(函数) help(“字符”) 解释安装指定程序包载入指定程序包(已安装) R 基本知识的查询获取指定函数的帮助页面获取指定字符的帮助页面 , 选项 try.all.packages=FALSE/TRUE, 或 package=“程序包” apropos(“字符”) 或 apropos(字符) 找出所有名中含指定字符的函数 help.search(“字符”) find(函数) 或 find(“函数”) args(函数) 或 args(“函数”) 列出所有在帮助页面含指定字符的函数得到含指定函数的程序包得到含指定函数的自变量列表二、数据对象的类型与建立类型向量建立命令 seq(from=,to=,by= )或： rep( ) c( ) scan( ) 解释产生较简单的序列通过重复产生复杂序列无规律的向量通过键盘逐个输入因子 factor(x,levels=sort(unique(x),na.last=T RUE),labels=levels,exclude=NA,ordere levels 指定水平,labels 指定水平名字,exclude 剔除水平值,ordered 水平是否排序 d=is.ordered(x)) gl(k,n) 数组 array(data,dim=向量,dimnames=向量) 矩阵 matrix(data,row,col ) 产生 k 个水平的因子序列,每个水平重复 n 次, 选项 length=个数, label=因子名. data 为构建数组之数据 ,dim 为维数向量,dimnames 为各维名称选项 byrow=FALSE 按列填充， rownames(),colnames()给行列赋名提取对角元 diag( ) t()转置,diag()提对角元,rbind()按行合并,cbind()按列合并,*逐元乘积,%*%代数积,det() 方阵行列式, data.frame(变量名=数据, 变量名= 数据) with(数据集,新变量) 在原数据框中添加新变量 transform(数据集,新变量 1,新变量 2) 一次性添加多个新定义变量 subset(data,条件) 提取满足条件的子集不同类型的数据 x,y,z…组成的对象 list(x,y,z) ts(data=NA,start=1,end=numeric(0),frequency=1,deltat=1,ts.eps=getOption(“ts.eps”),class, names) - 2 - 数据框列表时间序列

三、数据的浏览与编辑解释显示数据集的前 6 个观测值显示数据集的后 6 个观测值显示数据集中的变量命令 head(数据集) tail(数据集) names(数据集) data.entry(数据集) 通过数据编辑器打开数据集(可编辑) edit(数据集) fix(数据集) attach(数据集) detach(数据集) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 通过数据编辑器编辑数据集通过数据编辑器编辑数据集激活或挂接数据集，使之成为当前数据集卸载或挂起当前数据集显示所有在内存中的对象, 选项 pat=“字符”只显示名称带指定字符的对象显示内存中所有对象的详细信息, 选项 max.level=-1 规定详细级别删除内存中的对象 ls( ) 10 ls.str( ) 11 rm( 对象) 四、数据的运算 + 加法 - 减法 * 乘法(逐元乘积) / 除法 ^ 乘方 < 小于 > 大于 <= 小于或等于 >= 大于或等于 == 等于！x 逻辑非 x&y 逻辑与 x&&y 逻辑与(只作用第一个元素) x|y 逻辑或 x||y 逻辑或(只作用第一个元素) xor(x,y) 异或 det(A) 方阵的行列式 cbind(A,B) 按列合并矩阵 %% 模 %/% 整除 %*% 矩阵的代数积 apply(X, MARGIN=, FUN=)对 X 按 MARGIN 采取 FUN 运算,MARGIN=1 按列,=2 按行 sweep(X,MARGIN,STATS,FUN)对 X 按 MARGIN 采取 FUN 计算 STATS,并从 X 中除去 != 不等于 t(矩阵) 矩阵转置 rbind(A,B) 按行合并矩阵五、数据的存储与读取命令解释 write.table(数据,file=“存储路径”) write.csv( 数据 ,file=“ 存储路径”) save(数据,file=“存储路径”) 保存为 R 格式文件.Rdata 保存为文本文件 .txt, 选项 row.names=F 行名不写入文件 , quote=F 变量名不放双引号中保存为用逗号分割的文本文件.csv save.image( ) read.table(“文件地址”) read.csv( )或 read.csv2( ) read.delim()或 read.delim2() 读取用其他分割符分割的数据 scan(“文件名”,what=list(变量 what=为名义列表,可直接命名对象保存工作空间的映像读取表格形式数据,选项 header=TRUE 将第一行作为表头行读取用逗号分割的数据 - 3 -

名=变量类型) ) read.fwf(“文件地址”,widths= 向量,col.names=向量 ) Excel 数据读取：先 Ctrl+C 复制内容,再用命令 read.delim(“clipboard”) Excel 数据读取：library(RODBC)再 z<-odbcConnectExcel(“Excel 文件地址”)再 sqlFetch(z, 读取文件中固定宽度格式的数据 “Sheet1”), close(z) data( ) data( 数据集 ,package=“ 程序包” ) load(“R 文件地址”) 六、程序命令列出 R 的全部数据集载入指定程序包中指定数据集重新加载 R 数据 1 2 3 4 5 6 if(条件) 表达式 1 else 表达式 2 ifelse(条件，满足执行语句,否则执行) for(变量 in 向量) 表达式 while(条件) 表达式 repeat 表达式 if(条件)break 函数名=function(参数列表){函数体} 七、绘图函数命令 1 2 plot(x) plot(x,y) 3 sunflowerplot(x,y) 4 5 6 7 8 pie(x) boxplot(x) stripchart(x) coplot(x~y|z) interaction.plot(f1,f2,y) 9 matplot(x,y) 10 dotchart(x) 11 fourfoldplot(x) 12 assocplot(x) 13 mosaicplot(x) 14 pairs(x) 15 plot.ts(x) 解释以序号为横坐标,以 x 的元素值为纵坐标绘图以 x 为横 y 为纵坐标绘图 type="p" for points, "l" for lines, "b" for both, "c" for the lines part alone of "b", "o" for both „overplotted‟, "h" for „histogram‟ like (or „high-density‟) vertical lines, "s" for stair steps, "S" for other steps, see „Details‟ below, "n" for no plotting 以 x 为横 y 为纵坐标绘图, 相似坐标的点为花朵，花瓣数目为点的个数饼图箱形图将 x 的值画在一条线段上关于 z 的每个值绘 x 与 y 的二元图以 f1 为 x 轴,f2 的不同值对应不同曲线,作 y 的均值图, 选项 fun=函数,指定 y 的其他统计量 x 与 y 的相应列匹配作二元图, 各图在同一作图区域上若 x 是数据框,作 Cleveland 点图（逐行逐列累加图）用四个四分之一圆显示 2×2 列联表情况 Cohen-Friendly 图,显示在二维列联表中行、列变量偏离独立性的程度列联表的对数线性回归残差的马赛克图如果 x 是矩阵或数据框,作 x 的各列之间的二元图作 x 的时间序列曲线,x 多元时须有相同的频率和时间 - 4 -

16 ts.plot(x) 17 hist(x,probability=T) 18 barplot(x) 19 qqnorm(x) 20 qqplot(x,y) 21 contour(x,y,z) 22 23 filled.contour(x,y,z) image(x,y,z) 24 persp(x,y,z) 25 26 27 stars(x) symbols(x,y,…) termplot(mod.obj) 28 points(x,y) 29 30 lines(x,y) text(x,y,labels,) 31 mtext(text,side=3,line=0,…) 32 segments(x0,y0,x1,y1) 33 arrows (x0,y0,x1,y1,angle=30,code=2) 34 abline(a,b) 35 abline(h=y) 36 abline(v=x) 37 abline(lm.obj) 38 rect(x1,y1,x2,y2) 39 polygon(x,y) 40 41 legend(x,y,legend=“ ”) title( ) 42 axis(side,…) 43 box( ) rug(x) locator(n,type= “n”,…) 作 x 的时间序列曲线,x 多元时须有相同的频率 x 的频率直方图 x 的条形图正态分位数-分位数图 y 对 x 的分位数-分位数图等高线图 ,x 、 y 须为向量 ,z 为矩阵 dim(z)=c(length(x),length(y)) 等高线之间的区域是彩色的同上,实际数据大小用不同色彩表示同上, 但为透视图若 x 是矩阵或数据框，星形和线段画出在由 x 和 y 给定坐标画符号回归模型(mod.obj)的(偏)影响图添加点添加线在(x,y)处添加 labels 指定的文字在边空添加用 text 指定的文字,side 指定添加在哪边,line 指定添加文字距绘图区域的行数从(x0,y0)到(x1,y1)画线段同上,code=1,箭头从(x0,y0)到(x1,y1),code=2, (x1,y1) 到 (x0,y0),code=3,两端都有. 斜率为 b 截距为 a 的直线水平线垂直线由 lm.obj 确定的回归线绘长方形绘多边形在(x,y)处添加图例添加标题画坐标轴 ,side=1 画在下边 ,side=2 左边 ,side=3 上边,side=4 右边当前图上加边框在 x 轴上用短线标出 x 数据的位置鼠标点击 n 次后返回 n 个位置的坐标,并按 type 划点或线 44 45 46 47 text(x,y,expression(表达式)) 在图上加数学表达式 text(x,y,as.expression(substitut e(表达式，参数值))) 在表达式中代入某个变量值 48 curve(x ) 49 persp(x) 八、绘图参数命令画曲线三维透视图解释 - 5 -

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 add=FALSE axes=TRUE type= “p” xlim=, ylim= xlab=, ylab= main= sub= adj= bg= “ ” bty= “ ” cex col font las lty lwd mar mfcol=c(nr,nc) mfrow= c(nr,nc) pch=1:25 ps pty tck tcl xaxt= yaxt= par( ) TRUE 时表叠加图形到前一个图上 FALSE 时不绘制轴与边框指定图形的类型.p:点,l:线,b:点连线,o:点连线,线在点上,h:垂直线,s: 阶梯式,垂直线顶端显示数据,S:垂直线底端显示数据指定轴的上下限坐标轴的标签，字符型值主标题，字符型值副标题控制文字对齐方式.0:左对齐,0.5:居中,1:右对齐指定背景色控制图形边框形状. “o”, “l”, “7”, “”c, “u”, “]” 控制符号和文字大小.拓展:cex.axis,cex.lab,cex.main,cex.sub 控制符号颜色控制文字字体.1:正常,2:斜体,3:粗体,4:粗斜体控制坐标轴刻度数字标记方向.0:平行于轴,1:横排,2:垂直于轴,3:竖排控制连线线型.1:实线,2:虚线,3:点线,4:点虚线,5:长虚线,6:双虚线, 控制连线宽度的数字控制图形边空.c(bottom,left,top,right)四个值 c(nr,nc)向量分割窗口,按列使用子窗口 c(nr,nc)向量分割窗口,按行使用子窗口控制符号类型. 1:25 种样式控制文字大小的整数指定绘图区域类型的字符. “s”正方形, “m”最大利用指定轴上刻度长度值(百分比),以图形宽、高中最小一个作基数同上,但以文本行高度为基数 “n”设置 x 轴但不显示 “n”设置 y 轴但不显示后续图形按 par 中设定参数绘制九、常用概率分布命令 Beta Binomial Cauchy 分布密度 R 命令(d,p,q,r) 参数 _beta shape1,shape2 _binom size,prob _cauchy location=0,scale=1 Chi-sqaured _chisq df,ncp - 6 - 111(;,)(1),01(,)abfxabxxxBab(;,)(1)xxnxnfxnpCpp21(;,),01[1()]xabfxabxb22212(;),02()nxnnxefxnx

Dirichlet _dirichlet alpha Exponential Fisher-Snedecor Gamma Geometric Generalized Extreme Value Generalized Pareto Hypergeometric Inverse Gamma Inverse Wishart Logistic Lognormal Multinomial _exp _f rate df1,df2,ncp _gamma shape,scale=1 _geom _gev _gpd _hyper prob xi,mu,sigma xi=1,mu=0,sigma=1 m,n,k _invgamma shape,rate _iwish _logis _lnorm v,S location=0,scale=1 meanlog=0,sdlog=1 _multinom size,prob Multivariate Normal Multivariate-t Negative binomial _mvnorm mean,sigma _mvt sigma=diag(2),df=1 _nbinom size,prob Normal _norm mean=0,sd=1 Poisson _pois lambda Student‟s Uniform Weibull Wilcoxon‟s statistics Wishart 十、基本统计分析函数 1 max(x) 命令 _t df _unif min=0,max=1 _weibull _wilcox _signrank _wish shape,scale=1 m,n n v,S 解释返回向量 x 中最大元 - 7 - 111111()(,,;),1()ikikkikiikiiiifxxxx(;),0xfxex222122()(;,)(1)(,)mmmnmnmnmnfxmnxxB11(;,),0()xbaafxabxexab(;)(1)xfxppp(;,,)xkxmnkmnCCfxmnkC1(1)1(;,),0()bxaafxabxexab1(;,)[1]xabfxabe2(ln)221(;,),02xfxexx11111!(,,;,),!!kkxxkkiiknfxxnpppxnxx()(;,)(1)()()kxkxfxabppkx2()221(;,)2xfxe(;)!xfxex1221221(;)(1)(,)nxnnfxnnB1(;,),fxabaxbba1(;,),0bbaxfxababxex

2 min(x) 3 which.max(x) 4 which.min(x) 5 mean(x) 6 median(x) 7 mad(x) 8 9 var(x) sd(x) 10 range(x) 11 IQR(x) 12 quantile(x) 13 summary(x) 14 length(x) 15 mode(x) 16 sum(x) 17 prod(x) 18 rev(x) 19 sort(x) 20 order(x) 21 rank(x) 22 cumsum(x) 23 cumprod(x) 24 cumin(x) 25 cummax(x) 26 var(x,y) 27 cov(x,y) 28 cor(x,y) 29 outer(x,y) 30 sample(x,n) 31 choose(n,k) 32 density(x,bw=,kernel=“ ”) 33 kde2d(x,y) 34 hist(x,breaks=“ ”,freq=T) 35 stem(x) 36 skewness(x) 37 kurtosis(x) 38 basicStats( x) lowess( )或 loesss( ) 39 40 aggregate(数据框,分组变量,函数) 返回向量 x 中最小元返回 x 最大元的下标返回 x 最小元的下标计算样本 x 的均值计算样本 x 的中位数计算中位绝对离差 1.4826median(abs(x-median(x))) 计算样本 x 的方差计算样本 x 的标准差返回向量 c(min(x),max(x)) 计算样本 x 的四分位数极差计算样本 x 的常用分位数计算样本 x 的常用描述性统计量（五数概括）返回向量 x 的长度返回对象 x 的类型给出向量 x 的总和给出向量 x 的乘积取向量 x 的逆序按升序排序, 选项 decreasing=TRUE 表降序返回 x 的秩(升序), 选项 decreasing=TRUE 表降序返回 x 的秩返回向量 x 的累积和返回向量 x 的累积积返回向量 x 的累积最小值返回向量 x 的累积最大值计算样本 x,y 的协方差计算样本 x,y 的协方差计算样本 x,y 的相关系数计算样本 x,y 的外积从样本 x 中抽取 n 个个体,选项 replace=TRUE 表有放回抽样,prob=y 表 x 中元素出现的概率从 n 中抽 k 个组合 x 的核密度估计,bw 为窗宽,kernel 为选择光滑化函数 MASS 程序包中二维核密度估计 x 的频数直方图茎叶图样本的偏度系数（需加载 fBasics 程序包）样本的峰度系数（需加载 fBasics 程序包） fBasics 包中的命令,计算常用的统计特征量用一条非线性曲线拟合散点图对数据框的指定分组变量按指定函数统计分 - 8 -

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