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细胞分割与计数.doc

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大津阈值法 你们那个 FIGURE3 做的很好,做的比我好,你们可以用那幅图继续修改!加油! 以下是我做的,仅供参考哦! 1.首先你们的图我觉得有些暗,所以先调亮一些,可以用 imadjust 语句,如: im2=imadjust(i,[.3 .3 0;.7 .7 1],[]); 可以参考一下地址,自己进行修改。 http://baike.baidu.com/view/5769825.htm 2.然后进行灰度图转化,可以看出区别。(左边是直接转化,右边是调亮后转化) 3.之后转化为灰度图 im1=rgb2gray(im2); level=graythresh(im1); BW=im2bw(im1,level); 4.可以看出很多细胞没有闭合,所以可以使用膨胀和腐蚀,为的是尽可能使细胞 闭合,方便进一步计数。
se=strel('line',1,90); se1=strel('line',1,0); BW1=imdilate(BW,se); BW2=imerode(BW1,se1); 关于se=strel()的含义,一定要上网好好查查,老师也许会问到为什么选这个算 子。 http://blog.sina.com.cn/s/blog_877232310100tdv3.html 自己再去查查更多的资料。 5.去掉一些小的面积 BW3=bwareaopen(BW2,90); BW3=~BW3; BW4=bwareaopen(BW3,50); BW4=~BW4; 相当于从黑白两色一起去掉小面积单位,效果还是不错的。 http://baike.baidu.com/view/9216142.htm 简单来说就是自己定一个面积大小,然后小于这个面积全部忽略掉。 最后效果还不错。 6.然后计算数量。 k=bwlabel(~BW4); a=max(max(k)); ans
=243 如果我没记错,边缘检测是监测白色的对象,所以是对“~BW4”检测而不是对“BW4” 检测。 7.可以与原图相乘,清楚的展示你们分割出来了: BW5=i; for i=1:3; BW5(:,:,i)=BW5(:,:,i).*uint8(~BW4); end imshow(BW5);
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