Linux 下 freesurfer 安装流程： Linux 版本 ubuntu12.04 Freesurfer 版本 5.1.0 Freesurfer 是 .gz 的压缩文件 第一步，安装 ubuntu12.04 第二步，将 freesurfer 的.gz 文件考到 linux 下的桌面上 第三步，ctrl+alt+t 进入命令框 第四步，在命令框中输入 cd Desktop 命令框显示： administrator@ubuntu:~/Desktop$ 第五步，输入 sudo cp freesurfer 的压缩文件名 /usr/local 第六步，输入 sudo cd /usr/local 或者 cd /usr/local 即进入/usr/local 目录 第七步，在/usr/local 的路径下 输入 sudo tar -zxvf freesurfer 的压缩文件名 即 解压 freesurfer 的压缩文件 ，等待解压完成。 解压完成后 /usr/local 下多出一个文件名为 freesurfer 的文件夹 第八步，输入 tsch 指令 如果报无效，则需下载名为 tcsh_6.14.00-2_amd64.deb 的文 件。下载完后，拷贝到 inux 在的桌面上，在命令栏中进入桌面路径下即~/Desktop$下 输入 dpkg -i tcsh_6.14.00-2_amd64.deb。 第九步，待第八步完成后，在命令栏中为桌面路径下输入 sudo gedit /etc/profile 在所 打开文件的最后一行 输入 export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer 后保存 第十步，在命令栏中为桌面路径下输入 sudo gedit /etc/bash.bashrc 在所打开的文件 中输入 source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh 后保存。 第十一步，在命令栏中为桌面路径下输入 tkmedit 命令栏出现如 usage：。。。。 Anatomical Data 。。。。。。。。。。。。。。 一大陀的东西 说明安装成功哦