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系统发育分析纲要.pdf

发布时间：2022-06-03 发布人：admin 分类：说明书 资料大小：0.13M 资料格式：pdf 举报 版权申诉
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    《系统发育分析》基础点 1. 不同类型序列的多重序列比对 （TranslatorX/MAFFT） 2. 建树序列的保守区选择（Gblock） 3. 核苷酸饱和度检测（Xia's test） 4. 核苷酸替换模型的选择（jModeltest/MEGA/ModelFinder） 5. 氨基酸替换模型选择（ProtTest/MEGA/ /ModelFinder ） 6. NJ 法重建系统发育树 （MEGA） 7. ML 法重建系统发育树（MEGA/IQ-TREE/RAxML） 8. BI 法重建系统发育树（MrBayes） 9. 系统发育树的查看和美化（Figtree/MEGA）
    《系统发育分析》进阶点 1. 系统发育信号检测（Likelihood mapping analysis） 2. 核苷酸替换模型准确性检验（PhyloMad） 3. 系统发育分析的分区（PhyloSuite + ParttionFinder） 4. 拓扑结构检验（IQ-TREE）
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