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Weka操作手册.pdf
I The Command-line
A command-line primer
Introduction
Basic concepts
Dataset
Classifier
weka.filters
weka.classifiers
Examples
Additional packages and the package manager
Package management
Running installed learning algorithms
II The Graphical User Interface
Launching WEKA
Package Manager
Main window
Installing and removing packages
Using a http proxy
Using an alternative central package meta data repository
Simple CLI
Commands
Invocation
Command redirection
Command completion
Explorer
The user interface
Section Tabs
Status Box
Log Button
WEKA Status Icon
Graphical output
Preprocessing
Loading Data
The Current Relation
Working With Attributes
Working With Filters
Classification
Selecting a Classifier
Test Options
The Class Attribute
Training a Classifier
The Classifier Output Text
The Result List
Clustering
Selecting a Clusterer
Cluster Modes
Ignoring Attributes
Working with Filters
Learning Clusters
Associating
Setting Up
Learning Associations
Selecting Attributes
Searching and Evaluating
Options
Performing Selection
Visualizing
The scatter plot matrix
Selecting an individual 2D scatter plot
Selecting Instances
Experimenter
Introduction
Standard Experiments
Simple
New experiment
Results destination
Experiment type
Datasets
Iteration control
Algorithms
Saving the setup
Running an Experiment
Advanced
Defining an Experiment
Running an Experiment
Changing the Experiment Parameters
Other Result Producers
Cluster Experiments
Remote Experiments
Preparation
Database Server Setup
Remote Engine Setup
Configuring the Experimenter
Multi-core support
Troubleshooting
Analysing Results
Setup
Saving the Results
Changing the Baseline Scheme
Statistical Significance
Summary Test
Ranking Test
KnowledgeFlow
Introduction
Features
Components
DataSources
DataSinks
Filters
Classifiers
Clusterers
Evaluation
Visualization
Examples
Cross-validated J48
Plotting multiple ROC curves
Processing data incrementally
Plugins
Flow components
Perspectives
ArffViewer
Menus
Editing
Bayesian Network Classifiers
Introduction
Local score based structure learning
Local score metrics
Search algorithms
Conditional independence test based structure learning
Global score metric based structure learning
Fixed structure 'learning'
Distribution learning
Running from the command line
Inspecting Bayesian networks
Bayes Network GUI
Bayesian nets in the experimenter
Adding your own Bayesian network learners
FAQ
Future development
III Data
ARFF
Overview
Examples
The ARFF Header Section
The ARFF Data Section
Sparse ARFF files
Instance weights in ARFF files
XRFF
File extensions
Comparison
ARFF
XRFF
Sparse format
Compression
Useful features
Class attribute specification
Attribute weights
Instance weights
Converters
Introduction
Usage
File converters
Database converters
Stemmers
Introduction
Snowball stemmers
Using stemmers
Commandline
StringToWordVector
Adding new stemmers
Databases
Configuration files
Setup
Missing Datatypes
Stored Procedures
Troubleshooting
Windows databases
IV Appendix
Research
Citing Weka
Paper references
Using the API
Option handling
Loading data
Loading data from files
Loading data from databases
Creating datasets in memory
Defining the format
Adding data
Randomizing data
Filtering
Batch filtering
Filtering on-the-fly
Classification
Building a classifier
Evaluating a classifier
Classifying instances
Clustering
Building a clusterer
Evaluating a clusterer
Clustering instances
Selecting attributes
Using the meta-classifier
Using the filter
Using the API directly
Saving data
Saving data to files
Saving data to databases
Visualization
ROC curves
Graphs
Tree
BayesNet
Serialization
Extending WEKA
Writing a new Classifier
Choosing the base class
Additional interfaces
Packages
Implementation
Methods
Guidelines
Writing a new Filter
Default approach
Implementation
Examples
Simple approach
SimpleBatchFilter
SimpleStreamFilter
Internals
Capabilities
Packages
Revisions
Testing
Option handling
GenericObjectEditor
Source code
Unit tests
Writing other algorithms
Clusterers
Attribute selection
Associators
Extending the Explorer
Adding tabs
Requirements
Examples
Adding visualization plugins
Introduction
Predictions
Errors
Graphs
Trees
Weka Packages
Where does Weka store packages and other configuration stuff?
Anatomy of a package
The description file
Additional configuration files
Contributing a package
Creating a mirror of the package meta data repository
Technical documentation
ANT
Basics
Weka and ANT
CLASSPATH
Setting the CLASSPATH
RunWeka.bat
java -jar
Subversion
General
Source code
JUnit
Specific version
Clients
GenericObjectEditor
Introduction
File Structure
Exclusion
Class Discovery
Multiple Class Hierarchies
Capabilities
Properties
Precedence
Examples
XML
Command Line
Serialization of Experiments
Serialization of Classifiers
Bayesian Networks
XRFF files
Other resources
Mailing list
Troubleshooting
Weka download problems
OutOfMemoryException
Windows
Mac OSX
StackOverflowError
just-in-time (JIT) compiler
CSV file conversion
ARFF file doesn't load
Spaces in labels of ARFF files
CLASSPATH problems
Instance ID
Adding the ID
Removing the ID
Visualization
Memory consumption and Garbage collector
GUIChooser starts but not Experimenter or Explorer
KnowledgeFlow toolbars are empty
Links
Bibliography
WEKA Manual
for Version 3-7-5
Remco R. Bouckaert
Eibe Frank
Mark Hall
Richard Kirkby
Peter Reutemann
Alex Seewald
David Scuse
October 28, 2011
c2002-2011
University of Waikato, Hamilton, New Zealand
Alex Seewald (original Commnd-line primer)
David Scuse (original Experimenter tutorial)
This manual
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Contents
I The Command-line
1 A command-line primer
1.1
1.2 Basic concepts
Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1.2.1 Dataset . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1.2.2 Classifier
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1.2.3 weka.filters
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1.2.4 weka.classifiers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1.3 Examples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1.4 Additional packages and the package manager . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . .
1.4.1 Package management
1.4.2 Running installed learning algorithms
II The Graphical User Interface
2 Launching WEKA
3 Package Manager
3.1 Main window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3.2
Installing and removing packages . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3.3 Using a http proxy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3.4 Using an alternative central package meta data repository . . . .
4 Simple CLI
4.1 Commands
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
4.2
Invocation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
4.3 Command redirection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
4.4 Command completion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5 Explorer
5.1 The user interface
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Section Tabs
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.1.1
5.1.2
Status Box . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.1.3 Log Button . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.1.4 WEKA Status Icon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.1.5 Graphical output . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.2 Preprocessing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3
11
13
13
14
14
16
17
19
23
24
25
26
29
31
35
35
36
37
37
39
39
40
40
41
43
43
43
43
44
44
44
45
4
CONTENTS
5.2.1 Loading Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.2.2 The Current Relation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.2.3 Working With Attributes
5.2.4 Working With Filters
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.3 Classification . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Selecting a Classifier . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.3.1
5.3.2 Test Options
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.3.3 The Class Attribute . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.3.4 Training a Classifier . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.3.5 The Classifier Output Text
. . . . . . . . . . . . . . . . .
5.3.6 The Result List . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.4 Clustering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Selecting a Clusterer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.4.1
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.4.2 Cluster Modes
5.4.3
Ignoring Attributes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.4.4 Working with Filters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.4.5 Learning Clusters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.5 Associating . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.5.1
Setting Up . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.5.2 Learning Associations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.6.1
Searching and Evaluating . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.6.2 Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.6.3 Performing Selection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.7 Visualizing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.7.1 The scatter plot matrix . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Selecting an individual 2D scatter plot . . . . . . . . . . .
5.7.2
5.7.3
Selecting Instances . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.6 Selecting Attributes
6 Experimenter
6.2.1
Iteration control
6.1
Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Standard Experiments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Simple . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2.1.1 New experiment . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2.1.2 Results destination . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2.1.3 Experiment type . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2.1.4 Datasets
6.2.1.5
. . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2.1.6 Algorithms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2.1.7
Saving the setup . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2.1.8 Running an Experiment . . . . . . . . . . . . . .
6.2.2 Advanced . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2.2.1 Defining an Experiment . . . . . . . . . . . . . .
6.2.2.2 Running an Experiment . . . . . . . . . . . . . .
6.2.2.3 Changing the Experiment Parameters . . . . . .
6.2.2.4 Other Result Producers . . . . . . . . . . . . . .
6.3 Cluster Experiments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.4 Remote Experiments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.4.1 Preparation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.4.2 Database Server Setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
45
45
46
47
49
49
49
50
51
51
51
53
53
53
53
54
54
55
55
55
56
56
56
56
58
58
58
59
61
61
62
62
62
62
64
66
67
67
69
70
71
71
74
76
83
89
92
92
92
CONTENTS
5
93
6.4.3 Remote Engine Setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
94
6.4.4 Configuring the Experimenter . . . . . . . . . . . . . . . .
95
6.4.5 Multi-core support . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
95
6.4.6 Troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
97
6.5 Analysing Results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
97
6.5.1
6.5.2
Saving the Results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
6.5.3 Changing the Baseline Scheme . . . . . . . . . . . . . . . 100
6.5.4
Statistical Significance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101
6.5.5
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101
Summary Test
6.5.6 Ranking Test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102
7 KnowledgeFlow
103
7.1
Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
7.2 Features . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105
7.3 Components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
7.3.1 DataSources . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
7.3.2 DataSinks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
7.3.3 Filters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
7.3.4 Classifiers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
7.3.5 Clusterers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
7.3.6 Evaluation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
7.3.7 Visualization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
7.4 Examples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
7.4.1 Cross-validated J48
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
7.4.2 Plotting multiple ROC curves . . . . . . . . . . . . . . . . 111
7.4.3 Processing data incrementally . . . . . . . . . . . . . . . . 114
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
7.5.1 Flow components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
7.5.2 Perspectives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
7.5 Plugins
8 ArffViewer
119
8.1 Menus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
8.2 Editing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122
9 Bayesian Network Classifiers
Search algorithms
9.2.1 Local score metrics
9.2.2
125
9.1
Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125
9.2 Local score based structure learning . . . . . . . . . . . . . . . . 129
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 129
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130
9.3 Conditional independence test based structure learning . . . . . . 133
9.4 Global score metric based structure learning . . . . . . . . . . . . 135
9.5 Fixed structure ’learning’
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136
9.6 Distribution learning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136
9.7 Running from the command line . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138
Inspecting Bayesian networks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
9.8
9.9 Bayes Network GUI
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151
9.10 Bayesian nets in the experimenter
. . . . . . . . . . . . . . . . . 163
9.11 Adding your own Bayesian network learners . . . . . . . . . . . . 163
9.12 FAQ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 165
6
CONTENTS
9.13 Future development
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 166
III Data
169
10 ARFF
171
10.1 Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171
10.2 Examples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172
10.2.1 The ARFF Header Section . . . . . . . . . . . . . . . . . 172
10.2.2 The ARFF Data Section . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 174
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176
10.3 Sparse ARFF files
10.4 Instance weights in ARFF files
11 XRFF
177
11.1 File extensions
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
11.2 Comparison . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
11.2.1 ARFF . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
11.2.2 XRFF . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 178
11.3 Sparse format . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179
11.4 Compression . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180
11.5 Useful features
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180
11.5.1 Class attribute specification . . . . . . . . . . . . . . . . . 180
11.5.2 Attribute weights . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180
11.5.3 Instance weights
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 181
12 Converters
183
12.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 183
12.2 Usage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 184
12.2.1 File converters
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 184
12.2.2 Database converters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 184
13 Stemmers
187
13.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 187
13.2 Snowball stemmers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 187
13.3 Using stemmers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188
13.3.1 Commandline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188
13.3.2 StringToWordVector . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188
13.4 Adding new stemmers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188
14 Databases
189
14.1 Configuration files
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 189
14.2 Setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 190
14.3 Missing Datatypes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 191
14.4 Stored Procedures
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 192
14.5 Troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 193
15 Windows databases
195
CONTENTS
IV Appendix
7
199
16 Research
201
16.1 Citing Weka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201
16.2 Paper references
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201
17 Using the API
205
17.1 Option handling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 206
17.2 Loading data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 208
17.2.1 Loading data from files
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 208
17.2.2 Loading data from databases . . . . . . . . . . . . . . . . 209
17.3 Creating datasets in memory . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 212
17.3.1 Defining the format
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 212
17.3.2 Adding data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213
17.4 Randomizing data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 215
17.5 Filtering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 216
17.5.1 Batch filtering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 217
17.5.2 Filtering on-the-fly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 218
17.6 Classification . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 219
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 219
17.6.1 Building a classifier
17.6.2 Evaluating a classifier
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 221
17.6.3 Classifying instances . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 224
17.7 Clustering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 226
17.7.1 Building a clusterer
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 226
17.7.2 Evaluating a clusterer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 228
17.7.3 Clustering instances . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 230
17.8 Selecting attributes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 231
17.8.1 Using the meta-classifier . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 232
17.8.2 Using the filter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 233
17.8.3 Using the API directly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 234
17.9 Saving data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 235
17.9.1 Saving data to files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 235
17.9.2 Saving data to databases
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 235
17.10Visualization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 237
17.10.1 ROC curves . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 237
17.10.2 Graphs
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 238
17.10.2.1 Tree . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 238
17.10.2.2 BayesNet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 239
17.11Serialization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 240
18 Extending WEKA
243
18.1 Writing a new Classifier . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 244
18.1.1 Choosing the base class
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 244
18.1.2 Additional interfaces . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245
18.1.3 Packages . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245
18.1.4 Implementation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250
18.2 Writing a new Filter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256
18.2.1 Default approach . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256
18.1.4.1 Methods
18.1.4.2 Guidelines
8
CONTENTS
18.2.1.1 Implementation . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256
18.2.1.2 Examples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 259
18.2.2 Simple approach . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 263
18.2.2.1 SimpleBatchFilter . . . . . . . . . . . . . . . . . 263
18.2.2.2 SimpleStreamFilter
. . . . . . . . . . . . . . . . 265
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267
18.2.2.3 Internals
18.2.3 Capabilities . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267
18.2.4 Packages . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267
18.2.5 Revisions
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267
18.2.6 Testing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 268
18.2.6.1 Option handling . . . . . . . . . . . . . . . . . . 268
18.2.6.2 GenericObjectEditor . . . . . . . . . . . . . . . . 268
18.2.6.3 Source code . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 268
18.2.6.4 Unit tests . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 268
18.3 Writing other algorithms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269
18.3.1 Clusterers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269
18.3.2 Attribute selection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271
18.3.3 Associators . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275
18.4.1 Adding tabs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275
18.4.1.1 Requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275
18.4.1.2 Examples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275
. . . . . . . . . . . . . . . . 283
18.4.2.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283
18.4.2.2 Predictions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283
18.4.2.3 Errors . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286
18.4.2.4 Graphs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288
18.4.2.5 Trees
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 289
18.4.2 Adding visualization plugins
18.4 Extending the Explorer
19 Weka Packages
291
19.1 Where does Weka store packages and other configuration stuff? . 291
19.2 Anatomy of a package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 292
19.2.1 The description file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 292
19.2.2 Additional configuration files . . . . . . . . . . . . . . . . 296
19.3 Contributing a package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297
19.4 Creating a mirror of the package meta data repository . . . . . . 297
20 Technical documentation
301
20.1 ANT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301
20.1.1 Basics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301
20.1.2 Weka and ANT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301
20.2 CLASSPATH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 302
20.2.1 Setting the CLASSPATH . . . . . . . . . . . . . . . . . . 302
20.2.2 RunWeka.bat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303
20.2.3 java -jar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 304
20.3 Subversion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 304
20.3.1 General
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 304
20.3.2 Source code . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 304
20.3.3 JUnit
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 305
20.3.4 Specific version . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 305
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