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拉曼数据操作分析.pdf

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目录目录目录目录 ......................................................................................................................................... 2 ......................................................................................................................................... 5 ................................................................................................................ 5 ................................................................................................................ 7 ..................................................................................................................................... 8 ........................................................................................................................... 12 ................................................................................................................ 2 ........................................................................................................ 4 扣背底扣背底扣背底扣背底 (a)背底拟合法 (b)手动添加背底线 标峰位标峰位标峰位标峰位 (a)自动标峰位 (b)手动标峰位 峰位拟合峰位拟合峰位拟合峰位拟合 成像分析方法 成像分析方法 成像分析方法 成像分析方法 (a)夹峰法:可以在采集过程中实时显示成像 (b)经典最小二乘(CLS)法 (c)峰位拟合法:通过峰位拟合获得准确的峰强、半高宽、峰面积信息 (d)比值成像图 (e)成像图叠加到显微图像上 (f)3D显示 .............................................................................................................. 22 ...................................................................................... 23 ..................................................................................................................... 24 ........................................................... 12 ........................................................................................ 17 ............... 20
扣背底扣背底扣背底扣背底 0 680 700 720 780 740 760 28 000 26 000 24 000 660 22 000 20 000 18 000 16 000 14 000 12 000 8 000 6 000 4 000 2 000 10 000 baseline ) s t n u o c ( y t i s n e t n I Wavelength (nm) 2. 1. (a)背底拟合法 扣背底包括背底拟合法和手动添加背底线法,两种方法可任选其一或综合使用。扣背底可用 于单个谱图或成像数据,关于成像数据的扣背底会在成像分析中予以说明。 打开一条有背底的光谱 点击右边工具栏Processing->Baseline correction,选择合适的参数 Type:背底线类型 Line:线性,适合背底较平的谱图 Poly:多项式,适合背底是曲线的谱图 Degree:阶次 Max points:用于拟合的最大点数 Noise points:噪声点数,当谱线噪音较 大时,选用较多的噪声点数,运用此项时 必须先激活噪音修正(Correct noise)选 项。下图是使用与不使用噪声修正时背底 线的区别,使用噪声修正时,拟合的背底 底会自动添加到噪声的中部。 不使用噪声修正 使用噪声修正
3. 4. 点击Fit进行拟合。可尝试选用不同的参数, 再点击Fit,多次重复直到找到合适的背底线 为止。 适用于手动添加背底线 20 000 25 000 ) s t n u o c ( y t i s n e t n I 15 000 10 000 5 000 0 选择背底线颜色 点击Sub扣除背底。 10 000 12 000 8 000 ) s t n u o c ( y t i s n e t n I 6 000 4 000 2 000 0 1 000 2 000 Raman shift (cm-ı) 3 000 图示中红色线为拟合出的背底线 1 000 2 000 Raman shift (cm-ı) 3 000 扣除背底后获得基线平整的谱图
(b)手动添加背底线 ) s t n u o c ( y t i s n e t n I 25 000 25 000 20 000 ) s t 20 000 15 000 10 000 2. 1. 可直接使用手动方法获得背底线,也可以在背底拟合效果不好时,通过手动添加背底点 来优化背底线。 在左边工具栏中,选择Add/remove baseline points,通过鼠标单击在 谱线上添加背底线 手动添加背底线时,背底线的形状会受到 Baseline correction下参数的影响,如果不 希望受到这些干扰,可以选择Line,并将 Degree设为0。 在使用手动方法时,一般会勾选Attach to curve选项,如下图中,如果不勾选该选项, 则鼠标点击哪里,点就会出现在哪里;而勾选 该选项时,添加的点会自动挪到谱线上 Remove baseline清除背底线 不勾选Attach to curve 勾选Attach to curve 如果添加的点不好,可点击Remove baseline清除背底 线;如果只想取消其中某个点,可以把鼠标放到该点上,在 弹出的窗口中选中Remove移除该点,或选择Remove all移 除所有点。 4. 添加完毕后,点击Sub扣除背底。 2 000 Raman shift (cm-ı) 2 000 Raman shift (cm-ı) n u o c ( y t i 3. 15 000 10 000 5 000 5 000 0 s n e t n I 1 000 3 000 1 000 3 000 0
标峰位标峰位标峰位标峰位 800 1 000 1 200 Raman shift (cm-ı) 7 000 6 000 5 000 4 000 3 000 s n e t n I 2 000 1 000 0 600 2. 1. ) s t n u o c ( y t i (a)自动标峰位 标峰位包括自动标峰位及手动标峰位,两种方法可任选其一或综合使用。 打开一条需要标峰位的光谱 点击右边工具栏Analysis-> Peaks, 点击Find Ampl(%):强度阈值,若文本框中的数 字是10,则小于最大强度的10% 的峰将不会被标峰位。 Size(pix):间隔阈值,若文本框中的 数字是10,则当两个峰之间的间 隔小于10个像素时,该峰将不会 被标峰位。 注:可以直接在文本框里输入数值或 拖动滑条改变强度阈值和间隔阈值, 调整所要标的峰位 n u o c ( y t i 10 000 8 000 2 000 7 9 . 3 5 1 1 4 000 6 000 . 2 0 3 1 . 8 5 2 1 5 8 . 4 1 0 1 6 1 . 1 5 7 s n e t n 1 6 . 5 8 7 3 2 . 0 4 6 1 3 . 5 0 7 4 9 . 5 4 0 1 1 2 . 2 9 1 1 4 6 3 0 ) s t I 0 600 800 1 000 1 200 Raman shift (cm-ı) 正常标峰位结果
上图显示的是正常标峰位的结果,如果您获得的结果如上,则完成标峰位。 假如您获得的结果如下图,除了峰位显示之外,还有其它一些峰或线存在,则在 Analysis-> Peaks->Display options下取消勾选Peaks、Sum和Res行的选框使 其变灰色(注:可在峰位拟合章节步骤3中查看Peaks、Sum和Res的详细信息)。 此外,还可以在Display options下更改峰位显示的其它参数。 n u o c ( y t i 10 000 4 000 6 000 8 000 5 4 0 1 3 5 1 1 2 9 1 1 8 5 2 1 . 2 0 3 1 . 5 8 7 . 0 4 6 . 1 5 7 s n e ) s t 4 9 . 4 6 . 6 1 7 9 . 1 2 . 3 0 1 6 3 2 t n I 1 3 . 5 0 7 5 8 . 4 1 0 1 2 000 0 600 800 1 000 1 200 Raman shift (cm-ı) 勾选后,标记的 峰位会贴近谱线 更改峰位的 小数点位数 color Use data Remove peaks : 删除峰位标记 取消勾选 ,可选择不同 的颜色显示峰位 勾选后,峰位显示 颜色同谱图颜色 3.
(b)手动标峰位 1. 可直接使用手动方法标记某些特定的峰,也可以在自动标峰位无法获得一些需要标记的 峰位时,通过手动方法来实现。 在左边工具栏中选择Add/remove/edit peaks图标,将 鼠标移到需要标记的峰位上,点击鼠标左键添加峰位 新添加的峰 位 若点击的地方不是很准确,可通过微调来移动峰位 方法:将鼠标移到待修改峰位的标记上停留,使鼠标变成 ,然后移动鼠标使峰 位标记在正确的位置。 如果想要去除某个标记的峰位,则将鼠标移到该标记上,点击右键,选择Remove 即可。如果要取消所有标记,则选择Remove All。 2. 3.
峰位拟合 峰位拟合 峰位拟合峰位拟合 0 4 000 3 000 2 000 1 000 3 000 peakFit 5 000 4 000 350 400 450 s n e t n I 500 550 600 2. 1. ) s t n u o c ( y t i ) s t n u o c ( y t i Raman shift (cm-ı) 峰位拟合可以获得精确的峰位、峰强、半高宽和峰面积。 假如有些峰不是由单个独立的峰组成,而是由两个或两个以上的峰叠加合成,此时,若 要获得精确的峰信息,就需要对峰位进行拟合。拟合方法如下: 截取出需要进行拟合的峰,注意截取峰位的完整性。 如下图,假如我们要截取350-600cm-1范围的谱峰,则点击右边工具栏Processing->data range,在From和To里输入谱峰范围,再点击Extract即可。 扣除背底(详见扣背底章节) 通常峰位拟合的基线强度为0,如果峰的最小强度不为0,则可能拟合不到很好的结果。 左:未扣背底,红色为拟合出的背底线;右:扣背底之后 注:如果想要保留背底进行峰位拟合,则先拟合出背底线,如左上图,然后在后边第5 步所示的图片中勾选Fit Baseline,则可以保留背底获得准确的峰信息。 选择 在可能是峰的地方标上峰位(详见标峰位章节);具体该峰由哪几个峰位组成 需要我们自己对物质有一定的了解。如果不了解,可能需要经过多次拟合,以拟合结果 最接近实测曲线为准。如例子当中,我们先对比较明显的两个峰进行标峰位。 注意在峰位拟合中,我们需要勾选Analysis-> Peaks->Display options下的Peaks Raman shift (cm-ı) Raman shift (cm-ı) ) s t n u o c ( y t i 3. s n e t n I s n e t n I 1 000 400 450 500 550 600 2 000 3 000 4 000 400 450 500 550 600 1 000 2 000
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