目录目录目录目录
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扣背底扣背底扣背底扣背底
(a)背底拟合法
(b)手动添加背底线
标峰位标峰位标峰位标峰位
(a)自动标峰位
(b)手动标峰位
峰位拟合峰位拟合峰位拟合峰位拟合
成像分析方法
成像分析方法
成像分析方法
成像分析方法
(a)夹峰法:可以在采集过程中实时显示成像
(b)经典最小二乘(CLS)法
(c)峰位拟合法:通过峰位拟合获得准确的峰强、半高宽、峰面积信息
(d)比值成像图
(e)成像图叠加到显微图像上
(f)3D显示
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............... 20
扣背底扣背底扣背底扣背底
0
680
700
720
780
740
760
28 000
26 000
24 000
660
22 000
20 000
18 000
16 000
14 000
12 000
8 000
6 000
4 000
2 000
10 000
baseline
)
s
t
n
u
o
c
(
y
t
i
s
n
e
t
n
I
Wavelength (nm)
2.
1.
(a)背底拟合法
扣背底包括背底拟合法和手动添加背底线法,两种方法可任选其一或综合使用。扣背底可用
于单个谱图或成像数据,关于成像数据的扣背底会在成像分析中予以说明。
打开一条有背底的光谱
点击右边工具栏Processing->Baseline
correction,选择合适的参数
Type:背底线类型
Line:线性,适合背底较平的谱图
Poly:多项式,适合背底是曲线的谱图
Degree:阶次
Max points:用于拟合的最大点数
Noise points:噪声点数,当谱线噪音较
大时,选用较多的噪声点数,运用此项时
必须先激活噪音修正(Correct noise)选
项。下图是使用与不使用噪声修正时背底
线的区别,使用噪声修正时,拟合的背底
底会自动添加到噪声的中部。
不使用噪声修正 使用噪声修正
3.
4.
点击Fit进行拟合。可尝试选用不同的参数,
再点击Fit,多次重复直到找到合适的背底线
为止。
适用于手动添加背底线
20 000
25 000
)
s
t
n
u
o
c
(
y
t
i
s
n
e
t
n
I
15 000
10 000
5 000
0
选择背底线颜色
点击Sub扣除背底。
10 000
12 000
8 000
)
s
t
n
u
o
c
(
y
t
i
s
n
e
t
n
I
6 000
4 000
2 000
0
1 000
2 000
Raman shift (cm-ı)
3 000
图示中红色线为拟合出的背底线
1 000
2 000
Raman shift (cm-ı)
3 000
扣除背底后获得基线平整的谱图
(b)手动添加背底线
)
s
t
n
u
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c
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y
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i
s
n
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t
n
I
25 000
25 000
20 000
)
s
t
20 000
15 000
10 000
2.
1.
可直接使用手动方法获得背底线,也可以在背底拟合效果不好时,通过手动添加背底点
来优化背底线。
在左边工具栏中,选择Add/remove baseline points,通过鼠标单击在
谱线上添加背底线
手动添加背底线时,背底线的形状会受到
Baseline correction下参数的影响,如果不
希望受到这些干扰,可以选择Line,并将
Degree设为0。
在使用手动方法时,一般会勾选Attach to
curve选项,如下图中,如果不勾选该选项,
则鼠标点击哪里,点就会出现在哪里;而勾选
该选项时,添加的点会自动挪到谱线上
Remove baseline清除背底线
不勾选Attach to curve 勾选Attach to curve
如果添加的点不好,可点击Remove baseline清除背底
线;如果只想取消其中某个点,可以把鼠标放到该点上,在
弹出的窗口中选中Remove移除该点,或选择Remove all移
除所有点。
4.
添加完毕后,点击Sub扣除背底。
2 000
Raman shift (cm-ı)
2 000
Raman shift (cm-ı)
n
u
o
c
(
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t
i
3.
15 000
10 000
5 000
5 000
0
s
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e
t
n
I
1 000
3 000
1 000
3 000
0
标峰位标峰位标峰位标峰位
800
1 000
1 200
Raman shift (cm-ı)
7 000
6 000
5 000
4 000
3 000
s
n
e
t
n
I
2 000
1 000
0
600
2.
1.
)
s
t
n
u
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c
(
y
t
i
(a)自动标峰位
标峰位包括自动标峰位及手动标峰位,两种方法可任选其一或综合使用。
打开一条需要标峰位的光谱
点击右边工具栏Analysis-> Peaks,
点击Find
Ampl(%):强度阈值,若文本框中的数
字是10,则小于最大强度的10%
的峰将不会被标峰位。
Size(pix):间隔阈值,若文本框中的
数字是10,则当两个峰之间的间
隔小于10个像素时,该峰将不会
被标峰位。
注:可以直接在文本框里输入数值或
拖动滑条改变强度阈值和间隔阈值,
调整所要标的峰位
n
u
o
c
(
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t
i
10 000
8 000
2 000
7
9
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3
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1
4 000
6 000
.
2
0
3
1
.
8
5
2
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0
1
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1
.
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1
6
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5
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3
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0
4
6
1
3
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5
0
7
4
9
.
5
4
0
1
1
2
.
2
9
1
1
4
6
3
0
)
s
t
I
0
600
800
1 000
1 200
Raman shift (cm-ı)
正常标峰位结果
上图显示的是正常标峰位的结果,如果您获得的结果如上,则完成标峰位。
假如您获得的结果如下图,除了峰位显示之外,还有其它一些峰或线存在,则在
Analysis-> Peaks->Display options下取消勾选Peaks、Sum和Res行的选框使
其变灰色(注:可在峰位拟合章节步骤3中查看Peaks、Sum和Res的详细信息)。
此外,还可以在Display options下更改峰位显示的其它参数。
n
u
o
c
(
y
t
i
10 000
4 000
6 000
8 000
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4
0
1
3
5
1
1
2
9
1
1
8
5
2
1
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2
0
3
1
.
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8
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.
0
4
6
.
1
5
7
s
n
e
)
s
t
4
9
.
4
6
.
6
1
7
9
.
1
2
.
3
0
1
6
3
2
t
n
I
1
3
.
5
0
7
5
8
.
4
1
0
1
2 000
0
600
800
1 000
1 200
Raman shift (cm-ı)
勾选后,标记的
峰位会贴近谱线
更改峰位的
小数点位数
color
Use data
Remove peaks
:
删除峰位标记
取消勾选
,可选择不同
的颜色显示峰位
勾选后,峰位显示
颜色同谱图颜色
3.
(b)手动标峰位
1.
可直接使用手动方法标记某些特定的峰,也可以在自动标峰位无法获得一些需要标记的
峰位时,通过手动方法来实现。
在左边工具栏中选择Add/remove/edit peaks图标,将
鼠标移到需要标记的峰位上,点击鼠标左键添加峰位
新添加的峰
位
若点击的地方不是很准确,可通过微调来移动峰位
方法:将鼠标移到待修改峰位的标记上停留,使鼠标变成 ,然后移动鼠标使峰
位标记在正确的位置。
如果想要去除某个标记的峰位,则将鼠标移到该标记上,点击右键,选择Remove
即可。如果要取消所有标记,则选择Remove All。
2.
3.
峰位拟合
峰位拟合
峰位拟合峰位拟合
0
4 000
3 000
2 000
1 000
3 000
peakFit
5 000
4 000
350
400
450
s
n
e
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n
I
500
550
600
2.
1.
)
s
t
n
u
o
c
(
y
t
i
)
s
t
n
u
o
c
(
y
t
i
Raman shift (cm-ı)
峰位拟合可以获得精确的峰位、峰强、半高宽和峰面积。
假如有些峰不是由单个独立的峰组成,而是由两个或两个以上的峰叠加合成,此时,若
要获得精确的峰信息,就需要对峰位进行拟合。拟合方法如下:
截取出需要进行拟合的峰,注意截取峰位的完整性。
如下图,假如我们要截取350-600cm-1范围的谱峰,则点击右边工具栏Processing->data
range,在From和To里输入谱峰范围,再点击Extract即可。
扣除背底(详见扣背底章节)
通常峰位拟合的基线强度为0,如果峰的最小强度不为0,则可能拟合不到很好的结果。
左:未扣背底,红色为拟合出的背底线;右:扣背底之后
注:如果想要保留背底进行峰位拟合,则先拟合出背底线,如左上图,然后在后边第5
步所示的图片中勾选Fit Baseline,则可以保留背底获得准确的峰信息。
选择 在可能是峰的地方标上峰位(详见标峰位章节);具体该峰由哪几个峰位组成
需要我们自己对物质有一定的了解。如果不了解,可能需要经过多次拟合,以拟合结果
最接近实测曲线为准。如例子当中,我们先对比较明显的两个峰进行标峰位。
注意在峰位拟合中,我们需要勾选Analysis-> Peaks->Display options下的Peaks
Raman shift (cm-ı)
Raman shift (cm-ı)
)
s
t
n
u
o
c
(
y
t
i
3.
s
n
e
t
n
I
s
n
e
t
n
I
1 000
400
450
500
550
600
2 000
3 000
4 000
400
450
500
550
600
1 000
2 000