实时荧光定量
实时荧光定量
实验结果
PCRPCR实验结果
分析分析
Hao Angela
Field Application Specialist
Gene Expression Division
North China
Bio-Rad Laboratories
定量分析
•绝对定量
•相对定量
定量定量PCRPCR应用应用
定性分析
•SNP分析,基因扫描
•阴阳性判定
•熔解曲线分析
应用实例--基因表达分析
基因表达分析
应用实例
利用利用TaqMan
ERBB2 在乳腺肿瘤
在乳腺肿瘤
TaqMan技术研究
技术研究ERBB2
组织标本中的表达差异
组织标本中的表达差异
实验设计流程
实验设计流程
RNA提取
RNA定量
反转录(RT)
设计qPCR实验方法
RT-qPCR实验
结果分析
Aurum Total RNA kit
iScript cDNA Synthesis Kit
材料和方法
材料和方法
已知在50%的乳腺肿瘤样本中,ERBB2表达异常,
因此可以作为一个检测标准
选用GAPDH作为内标基因
-FAM标记的ERBB2探针
-VIC标记的GAPDH探针
标准品(质粒)构造标准曲线
多重PCR反应
-无逆转录酶对照(监控基因组污染)
阴性对照
-无RNA对照(空白)
•
•
•
•
•
RNARNA定性及定量分析
定性及定量分析
正常乳腺组织 RNA
5 hr. at
90°C
Intact
乳癌组织 RNA
Intact
7 hr. at
90°C
Intact
Intact
5 hr.
degradation
GAPDH
gene
degradati
7 hr.
on
Experion™ RNA
HighSens Chip
0.1-5 ng/μl
100-6,000 nt
Experion™ RNA
StdSens Chip
5-500 ng/μl
100-6,000 nt
一步法&两步法
一步法&两步法
iScript cDNA Synthesis Kit
1. 25°C 5 min
2. 42°C 30 min
3. 85°C 5 min
4. 冷却至4°C
在不同的反应管中运行RT & PCR
1. 反转录反应
加热灭活反转酶
1.反转录反应
2. PCR 反应
2. PCR 反应
设计设计qPCRqPCR实验方法
实验方法
Fam标记目标基因探针
VIC标记看家基因探针
1. 定性条件摸索
2. 荧光化学物质
• SYBR GREEN染料
• Taqman探针
3. 定量PCR条件优化
4. 单双通道相互验证