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非笛卡尔并行磁共振成像重建技术研究新进展.pdf

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第 38卷 第 8期 2017年 8月 仪 器 仪 表 学 报 ChineseJournalofScientificInstrument Vol38No8 Aug.2017 非笛卡尔并行磁共振成像重建技术研究新进展  吴振洲,常 严,徐雅洁,王 慧,杨晓冬 (中国科学院 苏州生物医学工程技术研究所医学影像室 苏州 215163) 摘 要:相对于传统的 k空间笛卡尔采样,非笛卡尔采样能够使得 k空间具有更高的覆盖效率,同时可以更有效地利用梯度系 统性能,减少 dB/dt值,避免引起人体不良的生理反应。k空间非笛卡尔采样和并行成像技术结合能够进一步提高成像速度,但 是也使得图像域中的伪影模式更加复杂,因此非笛卡尔并行磁共振成像重建具有更高的技术难度。综述了目前几种典型的非 笛卡尔并行成像重建技术,具体讨论了每种方法的技术细节和优缺点,包括敏感度编码(SENSE)、共轭梯度敏感度编码(CG SENSE)、非笛卡尔自标定并行采集方法(nonCartesianGRAPPA)、基于数据一致性的迭代方法(SPIRiT)和近年来发展迅速的压 缩感知技术。SENSE和 CGSENSE理论上可以获得最优的重建结果,但受制于线圈敏感度 分 布 的 准 确 测 量;NonCartesian GRAPPA无需测量线圈敏感度,但只能对特定的非笛卡尔采样模式进行近似计算;SPIRiT结合了 SENSE和 GRAPPA的优点,通 过迭代优化方法可以获得较满意的结果;压缩感知技术利用图像的稀疏变换特性,配合现有的迭代优化并行成像方法可以进一 步提升重建图像质量,将继续成为未来研究的热点。 关键词:磁共振成像技术;非笛卡尔采样;并行成像;压缩感知 中图分类号:R445.2 TH77   文献标识码:A  国家标准学科分类代码:320.1140 NewresearchadvancesinnonCartesianparallelMRIreconstruction WuZhenzhou,ChangYan,XuYajie,WangHui,YangXiaodong (MedicalImagingDivision,SuzhouInstituteofBiomedicalEngineeringandTechnology, ChineseAcademyofSciences,Suzhou215163,China) Abstract:ComparedwithconventionalCartesiankspacesampling,thenonCartesiansamplingcanenablehighercoverageeffeciencyof kspace,moreefficientlymakeuseofthegradientsystemperformance,andreducedB/dttopreventtocausetheundesirablehuman physiologicalreactions.ThecombinationofnonCartesiankspacesamplingandparallelimagingcanfurtheraccelerateimagingspeed, howevertheartifactpatterninimagedomainwouldbecomemuchmorecomplicated,whichintroducesalotoftechnicaldifficultiesto nonCartesianparallelMRIreconstruction.Inthisarticle,severaltypicalnonCartesianparallelimagingreconstructiontechniques includingSENSE,CGSENSE,nonCartesianGRAPPA,SPIRiTandnewlyemergingcompressedsensingarereviewed,theirtechnical details,advantagesanddisadvantagesarediscussed.SENSEandCGSENSEcanachieveoptimalreconstructionresultstheoretically,but bothofthemarerestrictedbytheaccuratemeasurementofcoilsensitivitydistribution.NonCartesianGRAPPAdoesn’trelyoncoil sensitivitymeasurement,butcanonlyperformapproximatecalculationforspecifiednonCartesiansamplingmode.SPIRiTcombinesthe advantagesofSENSEandGRAPPA,andcanobtainsatisfactoryresultbyusingiterativeoptimizationalgorithm.Takingtheadvantageof sparsetransformcharacteristicofimages,compressedsensingcooperatingwithexistingiterativeoptimizationparallelimagingmethodcan furtherimprovereconstructedimagequality,anditwillbeahotspotinthefuturestudy. Keywords:magneticresonanceimaging(MRI);nonCartesiansampling;parallelimaging;compressedsensing  收稿日期:201612  ReceivedDate:201612  基金项目:中科院科研装备研制项目(YZ201445)、国家自然科学基金(11505281)项目资助
 第 8期 0 引  言 吴振洲 等:非笛卡尔并行磁共振成像重建技术研究新进展 1997  partiallyparallelacquisitions,GRAPPA)等,因此必须对现 磁共振成像技术(magneticresonanceimaging,MRI) 由于具有能够实现任意空间方位成像、软组织对比度好、 图像空间分辨率高、无电离辐射、能够进行功能成像等优 点,已经成为一种重要的临床医学影像检查方法,但是 MRI较长的成像时间会引起运动伪影、被试舒适度降低 等问题,并且无法满足实时快速成像的需要,制约了其在 临床上的应用效率。由于人体生理上对梯度场的时间变 化率(dB/dt)的固有限制,已经很难通过继续提升梯度系 统硬件性能来缩短成像时间,而多通道射频接收线圈给 出了新的提高成像速度的方法。多通道接收线圈最初是 用来提高图像的信噪比,但各通道并行接收的信号中包 含了不同的线圈敏感度加权,利用这一加权信息可以省 略某些 Fourier编码步数,使 k空间欠采样,从而达到加 速成像的目的,由于欠采样的 k空间不再满足 Nyquist采 样定理,会在重建图像中产生伪影,需要通过特殊的算法 重建出没有伪影的图像,这就是所谓的并行成像技术。 这一想法最初由 KeltonJ.R.等人[1]于1989年提出,直到 20世纪 90年 代 末 期,空 间 谐 波 同 时 获 取 (simultaneous acquisitionofspatialharmonics,SMASH)[2]和敏感度编码 (sensitivityencoding,SENSE)[3]算法问世之后,并行成像 技术逐渐实用化,开始得到了广泛研究和应用,相应改进 优化的新算法也纷纷出现[413]。 相对于常规的均匀笛卡尔采样,k空间非笛卡尔采 样具有更 加 灵 活 的 方 式,常 见 的 包 括 螺 旋 状[14]、放 射 状[15]和车轮状[16]等。非笛卡尔采样在 k空间中心使用 高密度、在外围使用低密度采样,有效提高了 k空间的覆 盖效率[1415],同时由于 k空间能量主要集中在中心点附 近,受噪声影响较小,因此有助于提高图像的信噪比;此 外由于梯度编码是沿两个方向同时进行,梯度变化更加 连续,不会有某一个方向梯度的剧烈切换,因此可以使用 更高的梯度场强进行编码,提高了梯度系统硬件的使用 效率[17];最后,图像中的伪影与 k空间采样方式相关,非 笛卡尔采样是沿着各个方向进行数据采集的,因此伪影 能量也是沿着各个方向分布,这可以有效的抑制运动伪 影,甚至在低加速因子(R≤2)的并行成像时,无需进行 额外的校正算法即可得到无明显伪影的重建图像[1819]。 并行成像和非笛卡尔采样的相结合,即非笛卡尔并 行成像技术,在保留了二者优点的同时,也突破了各自对 有算法加以修改。目前已经有众多学者提出了各类非笛 卡尔并行成像重建算法,包括 SENSE、共轭梯度 SENSE (conjugategradientSENSE,CGSENSE)[20]、非 笛 卡 尔 自 标定并行采集方法(nonCartesianGRAPPA)[2124]、基于数 据一 致 性 的 迭 代 方 法 (iterativeselfconsistentparallel imagingreconstruction,SPIRiT)[25]、利用局部敏感度分布 的 方 法 (partially parallel imaging with localized sensitivities,PILS)[5,26]、利 用 k空 间 稀 疏 矩 阵 的 方 法 (parallelimagingforarbitrarytrajectoriesusingkspace sparsematrices,kSPA)[27]、利 用 k空 间 局 部 特 征 的 方 法 (parallelMRIwithadaptiveradiusinkspace,PARS)[2829]、 基于连续卷积操作的方法(parallelreconstructionbasedon successiveconvolutionoperations,BOSCO)[30]等。这些算 法既有利用线圈敏感度分布的 (如 SENSE、CGSENSE、 PILS、kSPA、PARS),也有通过自标定进行计算 (如 non CartesianGRAPPA、SPIRiT、BOSCO);既有在图像域内的 (如 SNESE、CGSENSE、PILS),也有在 k空 间 内 计 算 的 (如 nonCartesianGRAPPA、kSPA、PARS、BOSCO);既 有 利用迭代进行计算的(如 CGSENSE、SPIRiT),也有非迭 代类 的 直 接 计 算 (如 SENSE、nonCartesianGRAPPA、 PILS、kSPA、PARS、BOSCO)。本文详细介绍了几种具有 代表性的非笛卡尔并行成像重建算法,分别是 SENSE、 CGSENSE、nonCartesianGRAPPA和 SPIRiT,包 括 算 法 的具体流程以及各自的优缺点。其中 SENSE算法利用 线圈敏感度信息在图像域进行直接计算,是非笛卡尔并 行 MRI成像重建技术研究的基础;CGSENSE算法利用 线圈敏感度信息在图像域进行迭代计算,在 SENSE算法 的基 础 上 首 次 引 入 了 迭 代 优 化 思 路;NonCartesian GRAPPA通过自标定在 k空间域进行直接计算,是在目 前应用广泛的 GRAPPA算法基础上衍生而来;SPIRiT结 合了 SENSE和 GRAPPA的优点,通过自标定进行迭代计 算,既可在图像域也可在 k空间域得到重建结果,是一种 新颖的非笛卡尔并行成像重建方法。此外,压缩感知技 术是近十年来发展起来的全新数据采样理论,为欠采样 k空间的重建开辟了有一条新的道路,本文也介绍了压 缩感知理论用于非笛卡尔并行成像重建的理论框架。 1 任意 k空间采样模式下的 SENSE算法 SENSE算法最早由 PruessmannK.P.等人于 1999年 于采样加速的限制,可以实现更高加速因子的并行成像, 提出,给出了在笛卡尔采样情况下的图像域解卷褶方法, 进一步缩短图像的采集时间,但是相应地对重建算法提 出了更高的要求。由于 k空间数据呈现非笛卡尔分布模 即卷褶图像中的像素都是原始图像中对应像素和线圈敏 感度的加权求和,如果接收线圈通道数大于并行成像加 式,往往无法直接使用笛卡尔采样下的并行成像算法,如 SMASH、自标定并行采集方法(generalizedautocalibrating 速因子,就可以建立超定的线性方程组,将原始图像中的 信息恢复。相对于 SMASH算法只能用于笛卡尔采样 k
1998  空间,SENSE算法还可以方便地推广到任意非笛卡尔 k 仪 器 仪 表 学 报 第 38卷 程可以表示为: m =Ev 空间采样模式,即根据傅里叶变换的线性特性,得到图像 化为线性方程组的求解,直接得到线圈通道合并后的重 域与 k空间域之间的变换方程,从而将图像重建问题转 建图像结果。设线圈通道数为 nc,k空间采样点数为 nk, 所求图像的像素数为 nv,从图像域到 k空间域的编码过 (1) 式中:m和 v分别是 k空间域和图像域数据组成的向量, 大小分别为 ncnk×1和 nv×1;E称为编码矩阵,大小为 ncnk×nv。 (2) 式中:γ、κ、ρ分别为线圈通道、k空间位置和像素位置编 号,每个编码项都是由 Fourier编码 eikκrρ和线圈敏感度编 码 Sγ(rα)两部分组成,因此在已知 k空间采样规则和线 圈敏感度分布的情况下,编码矩阵 E可以直接得出。为 了得到重建图像结果 v,设置一个重建矩阵 F,其大小为 nv×ncnk,使得: E(γ,κ),ρ =eγ,κ(rρ)=eikκrρsγ(rρ) v=Fm (3) 式(3)即表示从 k空间域到图像域的重建过程,联合 式(1)可得: (4) FE =Idnv 式中:Idnv代表 nv维 单 位 矩 阵,在 满 足 ncnk≥nv 的 条 件 (5) 式中:上标 H指取共轭转置,Ψ 是 k空间噪声相关矩阵, 其对角线元素表示每个 k空间数据点的噪声自相关,非 对角元素表示对应不同 k空间数据点的噪声互相关。上 F =(EHψ-1E) 下,可以通过广义逆算法得到: -1EHψ-1 述重建流程最大的实现难度在于广义逆矩阵计算时巨大 的计算量,以 128×128图像大小、8线圈通道为例,若 k 空间采用64条放射线采集,则编码矩阵 E大小为(8×64 ×128)×1282 ,在计算单幅图像的重建矩阵 F时需要进行 大约1286 次运算,这对于当时的计算机运算速度来说会消 耗非常长的时间,即使用目前的处理器每秒可进行数十亿 次运算,完成单幅图像重建的时间也将达到上千秒(约几 十分钟),这是任何临床应用场景都无法忍受的长时间。 2 CGSENSE 由于使用 SENSE算法直接进行任意 k空间采样的 并行成像重建所需的计算量非常庞大,PruessmannK.P. 等人于 2001年又提出了一种基于 SENSE和共轭梯度迭 代方法的 CGSENSE算法[23]。将上述重建矩阵表达式 (5)代入重建方程(3),得到: -1EHψ-1m v=(EHψ-1E) (6) 通过噪声通道去相关,从而忽略噪声相关矩阵 Ψ,并 改写得到如下形式: (EHE)v=EHm (7) 因此任意 k空间采样的并行成像重建变成了无约束 条件下的最优化问题,通过设置适当的初始条件,使用 CG算法进行若干次迭代计算,可以较快地收敛得到最优 化解。由于编码矩阵 E由 Fourier编码和线圈敏感度编 码两部分组成,可以对 E和 EH 进行等效操作: (Ev)(γ,κ) =FT-1 [sγ(r)v(r)] kκ (EHm)ρ =∑γ (8) s γ (rρ)(FT[mγ(k)] rρ 式(8)表 示 E操 作 可 以 通 过 线 圈 敏 感 度 编 码 和 ) 操 作 可 以 通 过 Fourier逆 变 换 两 步 操 作 替 代,而 EH Fourier变换和线圈敏感度共轭加权求和两步操作替代。 但是由于采样得到的 k空间内数据是非笛卡尔模式,因 此在 EH 之前需要进行网格化操作,将 k空间转换为笛卡 尔分布,而在 E操作之后需要进行卷积重采样,生成相应 的非笛卡尔 k空间数据。上述等效操作有效提高了迭代 过程中的计算效率,避免了对编码矩阵 E进行直接计算, 使用快速傅里叶变换(fastFouriertransformation,FFT)还 可以进一步降低算法运算量。 还有一个影响 CGSENSE算法迭代收敛速率的因素 是数据预处理,通过预处理使得式(7)右侧更加接近真 实结果,可以使 CGSENSE算法更快地收敛,有效减少迭 代次数。预处理主要包括采样密度校正和图像强度校正 (IEHDEI)(I-1v)=IEHDm 两部分,在加入了上述预处理操作后,式(7)变换为: (9) 式中:D是采样密度校正矩阵,大小为 ncnk×ncnk,用来 消除任意采样时 k空间不同位置的采样密度差异;I是图 像强度校正矩阵,大小为 nv×nv,主要用来消除通道合并 后图像的线圈敏感度加权。值得一提的是,上述预处理 步骤可以忽略其中的任一或两个,只需直接将相应的校 正矩阵用单位阵替代即可。 另外一个需要考虑的因素是 CG迭代算法的初 始 值,选择适当的初始图像也有助于算法更快地收敛。在 加入了预处理之后,初始图像选择为一幅零图像即可,因 为经过首次迭代后计算出的图像结果已经是最终结果的 很好的近似;此外选择零图像作为初始值也避免了对像 素值单位的估算。 综上所述,完整的 CGSENSE重建算法流程如图 1 所示,主要包括以下几个步骤。 1)利用采集到的 k空间数据,代入到式(9)右侧,将 计算结果输入到 CG算法模块中; 值,迭代生成收敛的结果 I-1vfinal; 2)CG算法模块利用步骤 1)的输入值和预设的初始 3)对迭代结果 I-1vfinal进行图像强度校正 I,生成最 终的重建图像。
 第 8期 吴振洲 等:非笛卡尔并行磁共振成像重建技术研究新进展 1999  图 1 CGSENSE算法重建流程 Fig.1 ReconstructionflowchartofCGSENSEalgorithm    在 步 骤 2)中,每 一 次 迭 代 计 算 出 的 残 余 量 I-1vresiduum,根据式(9)的左侧所示,都需要乘以 IEHDEI, 重新输入到 CG算法模块中,以进行下一次迭代计算,这 可以用图 1中的循环结构表示:I-1vresiduum首先乘以图像 强度校正矩阵 I,接下来的 E操作可以用各通道线圈敏 感度加权 Sγ和 FFT逆变换(inverseFFT,IFFT)等效替 代,并对结果进行非笛卡尔重采样;为了最大限度地保 持采集数据一 致 性,将 各 通 道 原 始 采 集 数 据 覆 盖 对 应 的 k空间位置,并进行采样密度校正 D;经过网格化操 作重新生成笛卡尔 k空间之后,EH 操作可以用 FFT变 换和线圈敏感度共轭加权 S γ 等效替代,再进行各通道 结果相加,最后乘以 图 像 强 度 校 正 矩 阵 I,结 果 返 回 到 CG算法中。 以上两种方法都是基于 SENSE算法进行非笛卡尔 年提出的,并迅速得到了广泛的应用,算法隐式地利用 了线圈敏感度 的 空 间 分 布 信 息,无 需 对 线 圈 敏 感 度 进 行直接测量计算,其核心思想是 k空间中未采集的数据 可以通过相邻 采 集 数 据 的 线 性 加 权 组 合 来 近 似 得 出。 在此基础上,研 究 人 员 又 分 别 提 出 了 针 对 放 射 状 [2425] 和螺旋状 [2627]非笛卡尔 k空间采样的并行成像重建方 法。 拟合线 性 加 权 系 数 是 GRAPPA算 法 最 重 要 的 一 步,系数拟 合 的 准 确 性 直 接 决 定 了 重 建 图 像 的 质 量。 对于笛卡尔采样 k空间,由于未采集数据和采集数据之 间的相 对 位 置 关 系 固 定,因 此 通 过 全 采 样 的 自 标 定 (autocalibrationsignal,ACS)区域拟合得到少量几组线 性加权系数即可。但是对于非笛卡尔采样,k空间中不 同位置的未采集数据与相邻采集数据之间的相对位置 并行成像重建,二 者 共 同 的 缺 点 就 是 需 要 事 先 得 到 准 关系都是变化的,因此理论上来说,对 于 每 个 位 置 的 未 确的线圈各通 道 敏 感 度 空 间 分 布,否 则 将 会 在 重 建 图 采集数据,根据 周 围 采 集 数 据 的 位 置,都 需 要 一 组 对 像中残留伪 影,降 低 重 建 质 量。这 在 一 些 临 床 扫 描 中 应的加权系数,而 在 得 到 这 组 加 权 系 数 时,需 要 构 造 比较难获得,特 别 是 在 扫 描 区 域 内 存 在 较 大 的 密 度 差 足够数量的与 这 一 相 对 位 置 关 系 相 同 的 拟 合 数 据 组 异时,低密度区域很难获得有效的信号,使 得 该 区 域 内 合,以建立超定 的 线 性 方 程 组,使 得 方 程 组 的 解 稳 定 的线圈敏 感 度 分 布 估 计 存 在 较 大 误 差。 由 于 以 上 两 种方法对于线圈敏感度分布 的 依 赖 性,又 发 展 出 了 基 于 GRAPPA自标定 技 术 的 非 笛 卡 尔 并 行 成 像 重 建 方 法。 3 NonCartesianGRAPPA CGSENSE算法虽然使用了迭代优化方法,避免了 并且受噪声干扰较小,这成为 得 到 准 确 加 权 系 数 的 前 提 [31]。 NonCartesianGRAPPA算法一般通过采集一幅全采 样的 k空间作为 ACS参考数据,以放射状采样模式为例 (螺旋状采样可以通过改造变为放射状采样结构),为了 得到某一点对应的线性加权系数,以该点为中心,在 k空 间内沿螺旋方向和读出方向分割出一个区域,如图 2中 的实线区域所示,这个区域内的数据之间可以认为近似 对大重建矩阵 的 直 接 计 算,但 算 法 时 间 性 能 依 然 相 对 较低,相比之下,GRAPPA算法直接对 k空间数据进行 满足笛卡尔采样分布,因此各点与周围数据的位置关系 也近似相同,如果分割的区域足够大,就可以获得足够数 线性操作,无需迭代计算,因此算法的时间效率要高很 多。GRAPPA算 法 是 由 GriswoldM.A.等 人 [8]于 2002 量的拟合数据组合,使得线性方程组满足超定条件,获得 最优化的线性加权系数。
2000  仪 器 仪 表 学 报 第 38卷   但是分割区域大小的选择往往很难实现最优,如果 分割区域太小,就无法获得足够数量的拟合数据组合,导 致计算出的拟合系数不稳定且受噪声影响较大;而如果 分割区域太大,则区域内部的数据就无法满足近似笛卡 尔分布的条件,使得计算出的线性加权系数准确性降低。 为了解决这一问题,可以通过依次采集 n幅不相同的全 采样 k空间作为 ACS参考,如图3中所示,由于这些参考 k空间中在相同分割区域内都可以用来构造同一类的拟 合数据组合,这样就可以将每个分割区域内所需的拟合 数据组合数降低为原来的 1/n,从而有效缩小了分割区 域的大小,避免了区域过大产生的误差。在获得了 k空 间中所有位置的线性加权系数后,就可以应用于欠采样 k空间,拟合出其中的未采集数据,进而得到重建图像结 果。 图 2 放射状采样的 nonCartesianGRAPPA Fig.2 ReconstructionillustrationofnonCartesian 重建示意图 GRAPPAwithradialsampling 图 3 多次 ACS标定的 nonCartesianGRAPPA重建流程 Fig.3 ReconstructionflowchartofnonCartesianGRAPPAwithmultipleACScalibrateddata   这类基于 GRAPPA的非笛卡尔采样并行成像重建 方法,通常用于 MRI心脏或动态扫描,即在成像扫描之 外,单独采集一幅或多幅全采样 k空间数据作为 ACS参 考,保证线性加权系数的准确性;在实际成像扫描时,再 使用较高的加速因子提高时间分辨率,从而在较短的时 间内获得所需空间分辨率的图像。 4 SPIRiT SPIRiT是 利 用 k空 间 数 据 一 致 性 的 迭 代 重 建 方 法[29],结合 了 SENSE和 GRAPPA算 法 的 优 点,保 留 了 GRAPPA算法自标定、各通道单独重建的特点,避免对线 圈敏感度分布直接测量和运算,同时借鉴了 SENSE算法 中针对 k空间非笛卡尔采样的处理方法,依旧将并行成 像重建问题转化为最优化问题来进行迭代求解,同时可 以方 便 地 与 正 则 化、压 缩 感 知 等 方 法 进 一 步 结 合。 SPIRiT算法的依据是 k空间数据自身的一致性,包括校 准一致性和数据采集一致性,以构建优化问题目标方程。 传统的 GRAPPA算法中,在生成 k空间中未采集数 据时,只用到了相邻的采集数据。SPIRiT算法拓展了这 一思路,认为 k空间中任意位置的数据总是可以通过相 邻数据的线性加权叠加来进行拟合,而不考虑这些数据 是否被采集,因此建立起校准一致性方程: x=Gx (10) 式中:x是要求解出的完整的各通道笛卡尔形式 k空间 数据;G代表线性拟合系数矩阵,通过 k空间中全采样的 ACS区域拟合得出,并且由于每一点的拟合模式都相同, 因此只需计算一组拟合系数即可。式(10)直观的含义 是,如果 x是要求解的真实 k空间数据,那么通过相邻数 据对 x中每一点进行拟合得到的结果就是 x本身。 只利用式(10)是无法对 x求解的,还需要一个约束 条件,很自然地想到可以利用采集数据对 x进行约束, 即:求解出的 x中,与实际采样数据对应的部分应该尽量 y=Dx 保持一致性,从而建立起数据采集一致性方程: (11) 式中:y代表实际采集的 k空间数据,可以是任意采样模 式,D代表从完整 k空间 x中采样出数据 y的操作。利 用式(10)和(11)可以建立起非笛卡尔并行成像重建问
 第 8期 吴振洲 等:非笛卡尔并行磁共振成像重建技术研究新进展 题的最优化目标函数: minimize (G-I)x2 s.t.Dx-y2≤ ε (12) 式中:Dx-y2≤ε是约束条件,ε用来控制数据一致性的 误差。式(12)可以改写成更常见的无约束拉格朗日形式: (13) 式中:λ通常取经验值,用来平衡校准一致性和数据采集 一致性的权重。式(13)所示的最优化问题可以利用 CG argminx Dx-y2 +λ(ε) (G-I)x2 算法迭代求解,优化目标函数的梯度表达式为: Δx{ Dx-y2+λ (G-I)x2}=2D (Dx-y)+ (14) 分别是 D和 G的逆操作。由于 y是非笛 2λ(G -I)(G-I)x 式中:D 和 G 卡尔采样,在考虑数据采集一致性时,依然需要利用网格 算法实现笛卡尔和非笛卡尔 k空间之间的转换,即利用 卷积重采样操作实现从笛卡尔到非笛卡尔 k空间的变 换,利用卷积网格化操作实现非笛卡尔到笛卡尔 k空间 的变换。完整的 SPIRiT算法流程如图 4所示,主要包括 以下几个步骤。 1)综合考虑核函数大小、残留伪影等因素,选择合适 的卷积核函数,并确定采样矩阵 D; 2)确定校准系数拟合方式,并通过全采样的 ACS数 据,拟合得到一组线性加权系数,生成拟合矩阵 G; 3)利用 CG算法对式(13)进行迭代求解,得到最优 化的收敛结果 x; 4)将 x进行 Fourier逆变换生成各通道图像,并乘以 卷积核函数的 Fourier逆变换以消除网格算法产生的额 外加权分布,再通道合并(sumofsquares,SOS)生成最终 的重建结果。 图 4 SPIRiT算法重建流程 Fig.4 ReconstructionflowchartofSPIRiTalgorithm 2001  图 4所示的 SPIRiT算法流程中,目标函数的梯度是 根据式(14)来进行计算的,首先选择一个适当的迭代算 法输入 x,代表全采样的笛卡尔 k空间数据,然后分为左 右两个通路:经过左侧通路完成数据采集一致性的计算, 变换回笛卡尔分布得到 D 先经过 D变换到非笛卡尔分布,与实际采样数据 y相减 得到 y-Dx,再经过 D (y- Dx);经过右侧完成校准一致性的计算,先经过 G变换对 x自身进行拟合并求差值,得到 Gx-x=(G-I)x,再经 过 G 变换并求差值,得到(G -I)(G-I)x,最终乘以 权重系数 λ,与左侧计算结果相加后送入 CG模块。 上述 SPIRiT算法在进行 k空间内的网格算法操作 时,为了减少卷积核函数的通带纹波,需要增加卷积核函 数的大小,同时要配合 k空间过采样,来弥补卷积插值运 算的误差,这就不可避免地加大了每次迭代计算的运算 量。一个改进的办法是,迭代算法的初始输入和最终输 出都为 各 通 道 的 图 像 域 结 果,使 用 非 均 匀 FFT(non umiformFFT,NUFFT)[32]实现图像域与非笛卡尔 k空间 之间的变换 D和 D ,并且在进行校准一致性计算时,无 需再对每一点进行卷积拟合计算,只需将图像数据直接 乘以拟合矩阵 G和 G 的 IFFT变换即可,这可以大大减 少算法的计算量,配合 GPU并行计算可以进一步提高算 法时间性能。 5 压缩感知 前面介绍了几种用于非笛卡尔并行成像的具体重建 算法,有一个共同的特点:都显示或隐式地用到了线圈敏 感度的空间分布。但压缩感知技术从一个完全不同的角 度来处理欠采样 k空间的图像重建问题利用 MRI图像的 稀疏变换特性。因为 MRI图像本身也是一类图像信号,可 以利用图像压缩技术进行压缩存储和传输,因此可以很自 然地想到,既然压缩后能够保留重构原始图像的绝大部分 信息,那么在图像采集时,能否只采集少量必要的信息用 于图像重建,以达到减少数据采集量、缩短成像时间的目 的呢?压缩感知技术对上述问题给出了肯定的答案。 压缩感知是近十年发展起来的新型数据采样理论框 架[3338],将传统的信号采集问题转换为信息采集,可以用 远低于 Nyquist采样定理要求的速率实现信息采集,并不 失真地恢复出原始信号。压缩感知的理论指出,只要信 号在某个变换空间域内是稀疏的,就可以使用一个与稀 疏变换不相关的观测矩阵,将变换所得的高维信号投影 到一个低维空间上,然后利用优化求解的方法,从这些少 量的投影信息中高概率地重构出原始信号[39],其理论框 架如图 5所示。LustingM等人[40]于 2007年将压缩感知 理论框架应用于 MRI加速采集成像,建立起随机欠采样 笛卡尔 k空间的图像重建流程,但该流程可以很容易地 推广到非笛卡尔 k空间的情形。
2002  仪 器 仪 表 学 报 第 38卷 图 5 压缩感知理论框架 Fig.5 Theoreticalframeworkofcompressedsensing 压缩感知理论中定义了 3个数据空间,即信号空间、 稀疏变换空间和低维投影空间。在 MRI中,图像域和 k 空间域分别对应于信号空间和低维投影空间,从而可以 通过少量投影空间数据即 k空间欠采样,不失真地恢复 出信号空间,实现图像重建。根据压缩感知理论要求, MRI并行重建问题必须包括如下 3个内容。 1)MRI图 像 在 稀 疏 变 换 域 内 具 有 稀 疏 性:在 某 些 MRI图像如血管图像中,其图像域就具有良好的稀疏特 性,此时可以将空间有限差分或者直接恒等变换作为稀 疏变换;大部分 MRI图像在图像域不具备稀疏特性,但 仍然可以通过其他变换如离散余弦变换或者小波变换等 获得图像的稀疏变换表示。找到信号最佳的稀疏变换域 是压缩感知理论应用的基础和前提,选择合适的稀疏变 换域才能保证变换的稀疏度,从而保证信号的恢复精度。 如何根据不同的应用场景选择最优的稀疏变换,得到信 号的最稀疏表示,仍然是有待研究的问题。 2)观测矩阵与稀疏变换不相关:压缩感知中观测矩 阵的目的是将稀疏变换域内的高维信号投影到一个低维 空间中,保证原始信号中的信息不受破坏,也就是不会把 两个不同的稀疏变换结果映射到同一个采样集合中。由 于在 MRI中图像域和 k空间域固定满足傅里叶变换性 质,因此只能通过构造 k空间采样模式来满足这一要求, 使得在图像域产生不相关的伪影。最直观的方法是通过 对 k空间完全随机采样,但是这种方法不仅没有必要,而 且受到硬件和生理条件限制也难以实现,所以在实际情 况中,对于笛卡尔采样,可以只对相位编码步数进行随机 欠采样,从而仅在一个方向上产生不相关的伪影;相比之 下,非笛卡尔欠采样的图像域伪影更加复杂,能够在各个 规划问题,目前已经有多种算法可以用来求解上述最优 化问题,常用的有凸集投影法[34](projectionsontoconvex sets,POCS)、迭 代 软 阈 值[4143]、重 加 权 迭 代 最 小 二 乘 法[44]、非线性共轭梯度法[36]等。 压缩感知技术可以方便的与目前已有的基于迭代优 化的非笛卡尔并行成像算法相结合,以达到更佳的重建 结果,只需将图像最稀疏约束条件加入原先的优化目标 minimizex Joint1(ψx) 方程。以 SPIRiT算法为例,在加入了压缩感知约束条件 之后变为 1SPIRiT[4546],其优化目标方程为: subject to Fux=y Gx=x (16) 式中:Joint1表示联合 12范数,选择小波变换作为稀 疏变换 Ψ。利用 POCS算法对式(16)优化目标方程进行 求解的算法流程如图 6所示。 图 6 1SPIRiTPOCS算法流程 Fig.6 Flowchatof1SPIRiTPOCSalgorithm 图 6中的 G代 表 校 准 一 致 性 操 作,即 将 图 像 数 据 直接乘以拟合矩阵的 IFFT变换,W 代表软阈值小波分 解重构,F代表数据采集一致性操作,即将原始采样数 据覆盖对应的 k空间位置。每次迭代输出结果 xk+1都 返回算法输入端,继续进行下一次 迭 代,直 到 POCS算 方向产生不相关性,从而在稀疏变换域内产生的扰动更 法收敛。 加接近于噪声,提高图像重建的精度。 提下,可以将图像重建转化为带约束条件的最优化问题。 3)原始图像的优化求解:在满足以上两个条件的前 假设 x是重建出的图像信息,Ψ 表示一类稀疏变换,Fu 表示与 k空间欠采样模式对应的傅里叶变换,从而最优 化问题的目标方程为: minimize ψx1 s.t. Fux-y2 <ε (15) 式中:y是实际采集得到的 k空间数据,ε用来控制重建 图像与采样数据之间的误差,式(15)的直观解释是在满 足采集数据一致性的前提条件下,使图像在变换域实现 压缩感知理论尚处于快速发展阶段,很多问题仍需 进一步的研究探索,但是已经看到了广阔的应用前景。 将压缩感知与传统的并行成像技术相结合,可以进一步 提升 k空间欠采样度,在保留重建质量的前提下,实现更 加快速的成像速度。 6 结论与展望 本文总结了几种具有代表性的非笛卡尔并行成像重 建技术,其中 SENSE将并行成像重建问题转化为线性方 最稀疏。这是一个凸优化问题,可以方便地简化为线性 程组的求解,通过对构造的编码矩阵求逆,直接获得通道
 第 8期 吴振洲 等:非笛卡尔并行磁共振成像重建技术研究新进展 2003  合并后的重建图像;由于在编码矩阵求广义逆计算时需 要完成巨大的计算量,CGSENSE在 SENSE的基础上首 次引入了迭代优化思路,并通过将编码矩阵进行等效操 作,一定程度降低了算法的时间复杂度。在线圈敏感度 难实现最优,使得算法的鲁棒性降低,同时由于需要一幅 或多幅全采样的 ACS数据,占用了额外的扫描时间,进 一步限 制 了 临 床 应 用 场 景。SPIRiT结 合 了 SENSE和 GRAPPA二者的优点,利用 k空间自身的校准一致性和 空间分布可以准确获取的情况下,这两种方法都能获得 数据采集一致性分别构造优化目标方程,通过自标定避 最优的重建结果,但是在实际临床扫描时,线圈敏感度测 免了对线圈敏感度的直接测量,提高了算法的鲁棒性,利 量不仅会占用额外的扫描时间,测量得到的线圈敏感度 用迭代优化的方法可以方便地与其他约束条件相结合获 分布也往往存在较大的误差,这会在重建图像中带来残 留伪影,同时二者的较长的重建时间也制约了进一步的 应用。虽然目前临床上不使用线圈敏感度直接测量的并 行成像重建方法,SENSE作为非笛卡尔并行 MRI成像重 建技术研究的基础,依旧有必要进行深入学习了解,而 CGSENSE引入的迭代优化仍然是目前非笛卡尔并行成 像重建技术中重要的算法思路。NonCartesianGRAPPA 是在目前临床上广泛应用的 GRAPPA算法基础上衍生 而来,利用自标定方法对欠采样 k空间进行直接填充,避 免了迭代计算,从而大大提升了算法的时间性能,但是只 能针对特定非笛卡尔 k空间模式(放射状或者螺旋状)采 用笛卡尔近似分割,而在分割区域大小的选择时往往很 得最优解,在高加速因子的并行成像时可以获得更高信 噪比的重建图像,代表了 SENSE和 GRAPPA两类并行成 像技术的融合,配合 GPU并行计算还可以进一步降低算 法的时间消耗[4648],具有良好的应用前景。压缩感知技 术则从图像的稀疏变换特性来实现任意欠采样 k空间的 图像重建,通过构造图像在变换域的最稀疏表示,不失真 的恢复出原始图像,目前仍处于快速发展阶段;由于非笛 卡尔采样的图像域伪影沿各个方向不相关,更加适用于 压缩感知技术,配合传统的基于最优迭代方法的非笛卡 尔并行成像重建算法,已经获取了相当多令人欣喜的成 果[4956],在未来也将继续成为研究人员关注的焦点。各 种重建技术的对比如表 1所示。 Table1 ComparisonofvariousnonCartesianparallelimagingreconstructionalgorithms 表 1 各种非笛卡尔并行成像重建算法对比 算法名称 作者 年份 求解域 算法模式 标定 采样模式 特点 不足 SENSE PruessmannK.P.等人 1999年 图像域 非迭代 线圈敏感度 任意模式 算法简单易实现 CGSENSE PruessmannK.P.等人 2001年 图像域 nonCartesian GRAPPA GriswoldM.A.等人 LustingM等人 SPIRiT 2003~ 2011年 2010年 k空间域 非迭代 图像域/k 迭代 空间域 迭代 线圈敏感度 任意模式 自标定 放射状/ 螺旋状 自标定 任意模式 对编码矩阵 进行等效操作 算法时间性能高 既可在图像域 也可在 k空间域计算 压缩感知 LustingM等人 2007年 图像域 迭代 稀疏变换 任意模式 全新重建思路 计算量巨大, 依赖于线圈敏感度 依赖于线圈敏感度 近似计算, 难以实现最优分割 时间性能仍需提高 图像最稀疏表示 仍有待研究   非笛卡尔并行成像结合了非笛卡尔采样和并行成像 技术的优点,具有更高的 k空间覆盖效率、更有效的梯度 系统性能和更低的图像伪影,从而可以实现更高的加速 因子。相比传统的笛卡尔采样,这一技术在 k空间采集 策略,以及重建算法方面都提出了新的更高的要求,在本 文介绍的几种典型的非笛卡尔并行成像重建算法基础 上,以及近年来发展迅速的压缩感知理论框架,都将推动 非笛卡尔并行成像重建技术进一步往实用化方向发展, 在磁共振加速采集的应用需求驱动下,这一领域将继续 成为研究的热点。 参考文献 [1] KELTON JR, MAGIN R L, WRIGHT S M. An algorithm forrapid image acquisition using multiple receivercoils[C].ProceedingsoftheSMRM8thAnnual Meeting,1989:1172. [2] SODICKSON D K, MANNING W J. Simultaneous acquisitionofspatialharmonics(SMASH):Fastimaging withradiofrequencycoilarrays[J].MagneticResonance inMedicine,1997,38(4):591603. [3] PRUESSMANNKP,WEIGERM,SCHEIDEGGERM B,etal.SENSE:SensitivityencodingforfastMRI[J]. MagneticResonance in Medicine, 1999, 42(5): 952962. [4] JAKOBPM,GRISWOLDMA,EDELMANRR,etal. AUTOSMASH:AselfcalibratingtechniqueforSMASH imaging[J].MagneticResonanceMaterialinPhysics, BiologyandMedicine,1998,7(1):4254. [5] GRISWOLDM A,JAKOBPM,HEIDEMANNRM,
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