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SIMCA LC-MS教程.pdf

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BIOTREE SIMCA 14.1 操作教程 生物标记物筛选-LS/MS案例 百趣 生物
案例背景 l 本实验利用LC/MS平台,检测29个小鼠样本的代谢情况。实验分为三组:无胸腺裸鼠 (N),白色小鼠(W)和黑色小鼠(B),共检测到4145个代谢物。 l 实验结果用SIMCA 14.1 软件(Omics皮肤)进行分析建模。 l 通过建立PCA模型,查看总体分组情况。 l 通过建立OPLS-DA模型,创建S-Plot图,筛选差异代谢物。 l 利用OPLS-DA模型,创建SUS-Plot图,找到三组间差异代谢物并研究组间共同变化趋势。
导入数据 设置分组
Omics皮肤 选择Omics皮肤
分析小精灵(N组与W组) 打开分析小精灵 ‘Analysis wizard’ 将Type设置为‘MS’ 如图设置分组情况
数据概览(N组与W组) 可选中区域查 看分组情况
PCA模型(N组与W组) 分组情况 良好 模型验证 无异常值
OPLS-DA模型(N组与W组) 模型参数
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