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SIMCA 14.1 操作教程
生物标记物筛选-LS/MS案例
百趣 生物
案例背景
l 本实验利用LC/MS平台,检测29个小鼠样本的代谢情况。实验分为三组:无胸腺裸鼠
(N),白色小鼠(W)和黑色小鼠(B),共检测到4145个代谢物。
l 实验结果用SIMCA 14.1 软件(Omics皮肤)进行分析建模。
l 通过建立PCA模型,查看总体分组情况。
l 通过建立OPLS-DA模型,创建S-Plot图,筛选差异代谢物。
l 利用OPLS-DA模型,创建SUS-Plot图,找到三组间差异代谢物并研究组间共同变化趋势。
导入数据
设置分组
Omics皮肤
选择Omics皮肤
分析小精灵(N组与W组)
打开分析小精灵
‘Analysis wizard’
将Type设置为‘MS’
如图设置分组情况
数据概览(N组与W组)
可选中区域查
看分组情况
PCA模型(N组与W组)
分组情况
良好
模型验证
无异常值
OPLS-DA模型(N组与W组)
模型参数